Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4F1

FARP1, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP1Q9Y4F1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms