Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HCN4Q9Y3Q4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HCN4Q9Y3Q4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HCN4Q9Y3Q4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HCN4Q9Y3Q4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HCN4Q9Y3Q4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HCN4Q9Y3Q4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HCN4Q9Y3Q4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HCN4Q9Y3Q4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HCN4Q9Y3Q4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HCN4Q9Y3Q4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HCN4Q9Y3Q4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HCN4Q9Y3Q4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HCN4Q9Y3Q4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HCN4Q9Y3Q4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HCN4Q9Y3Q4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HCN4Q9Y3Q4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HCN4Q9Y3Q4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HCN4Q9Y3Q4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HCN4Q9Y3Q4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HCN4Q9Y3Q4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HCN4Q9Y3Q4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HCN4Q9Y3Q4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HCN4Q9Y3Q4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HCN4Q9Y3Q4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HCN4Q9Y3Q4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HCN4Q9Y3Q4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HCN4Q9Y3Q4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HCN4Q9Y3Q4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HCN4Q9Y3Q4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HCN4Q9Y3Q4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HCN4Q9Y3Q4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HCN4Q9Y3Q4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HCN4Q9Y3Q4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HCN4Q9Y3Q4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HCN4Q9Y3Q4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HCN4Q9Y3Q4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HCN4Q9Y3Q4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HCN4Q9Y3Q4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HCN4Q9Y3Q4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HCN4Q9Y3Q4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HCN4Q9Y3Q4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HCN4Q9Y3Q4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HCN4Q9Y3Q4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HCN4Q9Y3Q4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HCN4Q9Y3Q4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HCN4Q9Y3Q4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HCN4Q9Y3Q4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HCN4Q9Y3Q4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HCN4Q9Y3Q4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HCN4Q9Y3Q4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HCN4Q9Y3Q4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HCN4Q9Y3Q4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HCN4Q9Y3Q4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HCN4Q9Y3Q4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms