Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms