Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D8

SSX2IP, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2IPQ9Y2D8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms