Protein–RNA interactions for Protein: Q9XRX5

HHLA3, HERV-H LTR-associating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA3Q9XRX5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms