Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQN3

CHMP2B, Charged multivesicular body protein 2b, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2BQ9UQN3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP2BQ9UQN3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP2BQ9UQN3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP2BQ9UQN3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP2BQ9UQN3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP2BQ9UQN3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP2BQ9UQN3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP2BQ9UQN3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP2BQ9UQN3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP2BQ9UQN3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP2BQ9UQN3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP2BQ9UQN3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP2BQ9UQN3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP2BQ9UQN3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP2BQ9UQN3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP2BQ9UQN3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP2BQ9UQN3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP2BQ9UQN3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP2BQ9UQN3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP2BQ9UQN3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP2BQ9UQN3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP2BQ9UQN3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP2BQ9UQN3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP2BQ9UQN3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP2BQ9UQN3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP2BQ9UQN3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP2BQ9UQN3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP2BQ9UQN3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP2BQ9UQN3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP2BQ9UQN3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP2BQ9UQN3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP2BQ9UQN3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP2BQ9UQN3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP2BQ9UQN3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP2BQ9UQN3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP2BQ9UQN3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP2BQ9UQN3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP2BQ9UQN3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP2BQ9UQN3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP2BQ9UQN3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP2BQ9UQN3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP2BQ9UQN3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP2BQ9UQN3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP2BQ9UQN3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP2BQ9UQN3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms