Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQD0

SCN8A, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN8AQ9UQD0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SCN8AQ9UQD0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
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