Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPE1

SRPK3, SRSF protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPK3Q9UPE1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SRPK3Q9UPE1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SRPK3Q9UPE1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SRPK3Q9UPE1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SRPK3Q9UPE1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SRPK3Q9UPE1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SRPK3Q9UPE1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SRPK3Q9UPE1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SRPK3Q9UPE1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SRPK3Q9UPE1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SRPK3Q9UPE1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SRPK3Q9UPE1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SRPK3Q9UPE1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SRPK3Q9UPE1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SRPK3Q9UPE1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SRPK3Q9UPE1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRPK3Q9UPE1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRPK3Q9UPE1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SRPK3Q9UPE1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SRPK3Q9UPE1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRPK3Q9UPE1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRPK3Q9UPE1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRPK3Q9UPE1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRPK3Q9UPE1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRPK3Q9UPE1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SRPK3Q9UPE1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SRPK3Q9UPE1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SRPK3Q9UPE1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SRPK3Q9UPE1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SRPK3Q9UPE1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SRPK3Q9UPE1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SRPK3Q9UPE1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SRPK3Q9UPE1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SRPK3Q9UPE1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SRPK3Q9UPE1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SRPK3Q9UPE1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SRPK3Q9UPE1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SRPK3Q9UPE1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SRPK3Q9UPE1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SRPK3Q9UPE1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SRPK3Q9UPE1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SRPK3Q9UPE1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRPK3Q9UPE1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRPK3Q9UPE1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRPK3Q9UPE1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRPK3Q9UPE1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRPK3Q9UPE1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRPK3Q9UPE1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SRPK3Q9UPE1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRPK3Q9UPE1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRPK3Q9UPE1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SRPK3Q9UPE1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRPK3Q9UPE1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRPK3Q9UPE1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRPK3Q9UPE1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRPK3Q9UPE1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRPK3Q9UPE1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRPK3Q9UPE1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRPK3Q9UPE1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRPK3Q9UPE1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRPK3Q9UPE1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRPK3Q9UPE1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRPK3Q9UPE1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRPK3Q9UPE1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRPK3Q9UPE1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRPK3Q9UPE1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRPK3Q9UPE1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRPK3Q9UPE1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRPK3Q9UPE1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPK3Q9UPE1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPK3Q9UPE1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPK3Q9UPE1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPK3Q9UPE1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPK3Q9UPE1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPK3Q9UPE1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPK3Q9UPE1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPK3Q9UPE1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPK3Q9UPE1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPK3Q9UPE1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPK3Q9UPE1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPK3Q9UPE1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPK3Q9UPE1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPK3Q9UPE1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPK3Q9UPE1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPK3Q9UPE1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPK3Q9UPE1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPK3Q9UPE1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPK3Q9UPE1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPK3Q9UPE1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPK3Q9UPE1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPK3Q9UPE1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPK3Q9UPE1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPK3Q9UPE1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPK3Q9UPE1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPK3Q9UPE1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPK3Q9UPE1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPK3Q9UPE1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPK3Q9UPE1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPK3Q9UPE1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPK3Q9UPE1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms