Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

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Length 2,332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRQQ9UMZ3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRQQ9UMZ3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRQQ9UMZ3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRQQ9UMZ3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRQQ9UMZ3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRQQ9UMZ3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRQQ9UMZ3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRQQ9UMZ3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRQQ9UMZ3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRQQ9UMZ3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRQQ9UMZ3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRQQ9UMZ3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRQQ9UMZ3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRQQ9UMZ3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRQQ9UMZ3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRQQ9UMZ3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRQQ9UMZ3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRQQ9UMZ3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRQQ9UMZ3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRQQ9UMZ3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRQQ9UMZ3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRQQ9UMZ3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRQQ9UMZ3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRQQ9UMZ3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRQQ9UMZ3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRQQ9UMZ3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRQQ9UMZ3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRQQ9UMZ3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRQQ9UMZ3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRQQ9UMZ3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRQQ9UMZ3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRQQ9UMZ3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRQQ9UMZ3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRQQ9UMZ3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRQQ9UMZ3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRQQ9UMZ3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPRQQ9UMZ3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRQQ9UMZ3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRQQ9UMZ3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRQQ9UMZ3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRQQ9UMZ3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRQQ9UMZ3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRQQ9UMZ3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRQQ9UMZ3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRQQ9UMZ3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRQQ9UMZ3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRQQ9UMZ3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRQQ9UMZ3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRQQ9UMZ3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRQQ9UMZ3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRQQ9UMZ3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRQQ9UMZ3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRQQ9UMZ3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRQQ9UMZ3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRQQ9UMZ3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRQQ9UMZ3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRQQ9UMZ3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRQQ9UMZ3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRQQ9UMZ3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRQQ9UMZ3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRQQ9UMZ3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRQQ9UMZ3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRQQ9UMZ3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRQQ9UMZ3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRQQ9UMZ3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRQQ9UMZ3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRQQ9UMZ3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRQQ9UMZ3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRQQ9UMZ3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRQQ9UMZ3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRQQ9UMZ3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRQQ9UMZ3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRQQ9UMZ3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRQQ9UMZ3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRQQ9UMZ3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRQQ9UMZ3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRQQ9UMZ3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRQQ9UMZ3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRQQ9UMZ3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRQQ9UMZ3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRQQ9UMZ3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRQQ9UMZ3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRQQ9UMZ3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRQQ9UMZ3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRQQ9UMZ3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRQQ9UMZ3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRQQ9UMZ3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRQQ9UMZ3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRQQ9UMZ3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRQQ9UMZ3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRQQ9UMZ3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRQQ9UMZ3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRQQ9UMZ3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRQQ9UMZ3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRQQ9UMZ3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRQQ9UMZ3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRQQ9UMZ3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRQQ9UMZ3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRQQ9UMZ3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
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