Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNPO2Q9UMS6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNPO2Q9UMS6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNPO2Q9UMS6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNPO2Q9UMS6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNPO2Q9UMS6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNPO2Q9UMS6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNPO2Q9UMS6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNPO2Q9UMS6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNPO2Q9UMS6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNPO2Q9UMS6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNPO2Q9UMS6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNPO2Q9UMS6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNPO2Q9UMS6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNPO2Q9UMS6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNPO2Q9UMS6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNPO2Q9UMS6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNPO2Q9UMS6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNPO2Q9UMS6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNPO2Q9UMS6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNPO2Q9UMS6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYNPO2Q9UMS6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYNPO2Q9UMS6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYNPO2Q9UMS6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYNPO2Q9UMS6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SYNPO2Q9UMS6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SYNPO2Q9UMS6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNPO2Q9UMS6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNPO2Q9UMS6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNPO2Q9UMS6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNPO2Q9UMS6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNPO2Q9UMS6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNPO2Q9UMS6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNPO2Q9UMS6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNPO2Q9UMS6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNPO2Q9UMS6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNPO2Q9UMS6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNPO2Q9UMS6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNPO2Q9UMS6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNPO2Q9UMS6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNPO2Q9UMS6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNPO2Q9UMS6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNPO2Q9UMS6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNPO2Q9UMS6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNPO2Q9UMS6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNPO2Q9UMS6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNPO2Q9UMS6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNPO2Q9UMS6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNPO2Q9UMS6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNPO2Q9UMS6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNPO2Q9UMS6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNPO2Q9UMS6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNPO2Q9UMS6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNPO2Q9UMS6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNPO2Q9UMS6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNPO2Q9UMS6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNPO2Q9UMS6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNPO2Q9UMS6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNPO2Q9UMS6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNPO2Q9UMS6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNPO2Q9UMS6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNPO2Q9UMS6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNPO2Q9UMS6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNPO2Q9UMS6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNPO2Q9UMS6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNPO2Q9UMS6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNPO2Q9UMS6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNPO2Q9UMS6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNPO2Q9UMS6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNPO2Q9UMS6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNPO2Q9UMS6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNPO2Q9UMS6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNPO2Q9UMS6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNPO2Q9UMS6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNPO2Q9UMS6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNPO2Q9UMS6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNPO2Q9UMS6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNPO2Q9UMS6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNPO2Q9UMS6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNPO2Q9UMS6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNPO2Q9UMS6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNPO2Q9UMS6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNPO2Q9UMS6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNPO2Q9UMS6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNPO2Q9UMS6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNPO2Q9UMS6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNPO2Q9UMS6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNPO2Q9UMS6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNPO2Q9UMS6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNPO2Q9UMS6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNPO2Q9UMS6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNPO2Q9UMS6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNPO2Q9UMS6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNPO2Q9UMS6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNPO2Q9UMS6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNPO2Q9UMS6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNPO2Q9UMS6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNPO2Q9UMS6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNPO2Q9UMS6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNPO2Q9UMS6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms