Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TPCN1Q9ULQ1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPCN1Q9ULQ1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPCN1Q9ULQ1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPCN1Q9ULQ1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPCN1Q9ULQ1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPCN1Q9ULQ1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPCN1Q9ULQ1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPCN1Q9ULQ1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPCN1Q9ULQ1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPCN1Q9ULQ1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPCN1Q9ULQ1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TPCN1Q9ULQ1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TPCN1Q9ULQ1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TPCN1Q9ULQ1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TPCN1Q9ULQ1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TPCN1Q9ULQ1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TPCN1Q9ULQ1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TPCN1Q9ULQ1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TPCN1Q9ULQ1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TPCN1Q9ULQ1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TPCN1Q9ULQ1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TPCN1Q9ULQ1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TPCN1Q9ULQ1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TPCN1Q9ULQ1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TPCN1Q9ULQ1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TPCN1Q9ULQ1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TPCN1Q9ULQ1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TPCN1Q9ULQ1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TPCN1Q9ULQ1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TPCN1Q9ULQ1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TPCN1Q9ULQ1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TPCN1Q9ULQ1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TPCN1Q9ULQ1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TPCN1Q9ULQ1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TPCN1Q9ULQ1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TPCN1Q9ULQ1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TPCN1Q9ULQ1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TPCN1Q9ULQ1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TPCN1Q9ULQ1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TPCN1Q9ULQ1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TPCN1Q9ULQ1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TPCN1Q9ULQ1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TPCN1Q9ULQ1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TPCN1Q9ULQ1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TPCN1Q9ULQ1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TPCN1Q9ULQ1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TPCN1Q9ULQ1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TPCN1Q9ULQ1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TPCN1Q9ULQ1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TPCN1Q9ULQ1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TPCN1Q9ULQ1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TPCN1Q9ULQ1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TPCN1Q9ULQ1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TPCN1Q9ULQ1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TPCN1Q9ULQ1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TPCN1Q9ULQ1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TPCN1Q9ULQ1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TPCN1Q9ULQ1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TPCN1Q9ULQ1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TPCN1Q9ULQ1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TPCN1Q9ULQ1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TPCN1Q9ULQ1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TPCN1Q9ULQ1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TPCN1Q9ULQ1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TPCN1Q9ULQ1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TPCN1Q9ULQ1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TPCN1Q9ULQ1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TPCN1Q9ULQ1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TPCN1Q9ULQ1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TPCN1Q9ULQ1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TPCN1Q9ULQ1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TPCN1Q9ULQ1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TPCN1Q9ULQ1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TPCN1Q9ULQ1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TPCN1Q9ULQ1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TPCN1Q9ULQ1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TPCN1Q9ULQ1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TPCN1Q9ULQ1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TPCN1Q9ULQ1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TPCN1Q9ULQ1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TPCN1Q9ULQ1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TPCN1Q9ULQ1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TPCN1Q9ULQ1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TPCN1Q9ULQ1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TPCN1Q9ULQ1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TPCN1Q9ULQ1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TPCN1Q9ULQ1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TPCN1Q9ULQ1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TPCN1Q9ULQ1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TPCN1Q9ULQ1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TPCN1Q9ULQ1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TPCN1Q9ULQ1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TPCN1Q9ULQ1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TPCN1Q9ULQ1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TPCN1Q9ULQ1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TPCN1Q9ULQ1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TPCN1Q9ULQ1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TPCN1Q9ULQ1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TPCN1Q9ULQ1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
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