Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FBXO4Q9UKT5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO4Q9UKT5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO4Q9UKT5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO4Q9UKT5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO4Q9UKT5 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO4Q9UKT5 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO4Q9UKT5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO4Q9UKT5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO4Q9UKT5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO4Q9UKT5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO4Q9UKT5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO4Q9UKT5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO4Q9UKT5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO4Q9UKT5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO4Q9UKT5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO4Q9UKT5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms