Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCNL1Q9UK58 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCNL1Q9UK58 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCNL1Q9UK58 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCNL1Q9UK58 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCNL1Q9UK58 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCNL1Q9UK58 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCNL1Q9UK58 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCNL1Q9UK58 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCNL1Q9UK58 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCNL1Q9UK58 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCNL1Q9UK58 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCNL1Q9UK58 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CCNL1Q9UK58 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CCNL1Q9UK58 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCNL1Q9UK58 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCNL1Q9UK58 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCNL1Q9UK58 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCNL1Q9UK58 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCNL1Q9UK58 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCNL1Q9UK58 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCNL1Q9UK58 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCNL1Q9UK58 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCNL1Q9UK58 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCNL1Q9UK58 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCNL1Q9UK58 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCNL1Q9UK58 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCNL1Q9UK58 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CCNL1Q9UK58 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCNL1Q9UK58 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCNL1Q9UK58 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CCNL1Q9UK58 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCNL1Q9UK58 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCNL1Q9UK58 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCNL1Q9UK58 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCNL1Q9UK58 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCNL1Q9UK58 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCNL1Q9UK58 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CCNL1Q9UK58 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCNL1Q9UK58 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCNL1Q9UK58 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCNL1Q9UK58 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCNL1Q9UK58 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCNL1Q9UK58 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CCNL1Q9UK58 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCNL1Q9UK58 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCNL1Q9UK58 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCNL1Q9UK58 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CCNL1Q9UK58 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCNL1Q9UK58 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCNL1Q9UK58 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCNL1Q9UK58 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCNL1Q9UK58 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCNL1Q9UK58 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCNL1Q9UK58 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCNL1Q9UK58 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCNL1Q9UK58 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCNL1Q9UK58 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCNL1Q9UK58 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCNL1Q9UK58 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCNL1Q9UK58 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCNL1Q9UK58 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCNL1Q9UK58 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCNL1Q9UK58 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCNL1Q9UK58 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCNL1Q9UK58 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCNL1Q9UK58 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCNL1Q9UK58 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCNL1Q9UK58 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCNL1Q9UK58 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCNL1Q9UK58 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCNL1Q9UK58 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCNL1Q9UK58 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCNL1Q9UK58 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCNL1Q9UK58 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCNL1Q9UK58 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCNL1Q9UK58 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCNL1Q9UK58 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCNL1Q9UK58 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCNL1Q9UK58 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CCNL1Q9UK58 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CCNL1Q9UK58 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCNL1Q9UK58 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCNL1Q9UK58 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCNL1Q9UK58 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCNL1Q9UK58 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCNL1Q9UK58 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCNL1Q9UK58 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCNL1Q9UK58 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
CCNL1Q9UK58 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
CCNL1Q9UK58 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCNL1Q9UK58 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCNL1Q9UK58 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCNL1Q9UK58 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCNL1Q9UK58 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCNL1Q9UK58 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CCNL1Q9UK58 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCNL1Q9UK58 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCNL1Q9UK58 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCNL1Q9UK58 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms