Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJX2

CDC23, Cell division cycle protein 23 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC23Q9UJX2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms