Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms