Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFF9

CNOT8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT8Q9UFF9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms