Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms