Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
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