Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC9

SPRR3, Small proline-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR3Q9UBC9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms