Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms