Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY43

BARHL2, BarH-like 2 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL2Q9NY43 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BARHL2Q9NY43 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BARHL2Q9NY43 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BARHL2Q9NY43 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BARHL2Q9NY43 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
BARHL2Q9NY43 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BARHL2Q9NY43 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BARHL2Q9NY43 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BARHL2Q9NY43 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BARHL2Q9NY43 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BARHL2Q9NY43 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
BARHL2Q9NY43 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BARHL2Q9NY43 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BARHL2Q9NY43 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BARHL2Q9NY43 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BARHL2Q9NY43 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BARHL2Q9NY43 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BARHL2Q9NY43 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BARHL2Q9NY43 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BARHL2Q9NY43 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BARHL2Q9NY43 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
BARHL2Q9NY43 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BARHL2Q9NY43 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BARHL2Q9NY43 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BARHL2Q9NY43 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BARHL2Q9NY43 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BARHL2Q9NY43 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BARHL2Q9NY43 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BARHL2Q9NY43 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
BARHL2Q9NY43 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
BARHL2Q9NY43 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
BARHL2Q9NY43 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BARHL2Q9NY43 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BARHL2Q9NY43 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BARHL2Q9NY43 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BARHL2Q9NY43 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BARHL2Q9NY43 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BARHL2Q9NY43 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BARHL2Q9NY43 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BARHL2Q9NY43 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BARHL2Q9NY43 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BARHL2Q9NY43 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BARHL2Q9NY43 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BARHL2Q9NY43 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BARHL2Q9NY43 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BARHL2Q9NY43 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BARHL2Q9NY43 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BARHL2Q9NY43 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BARHL2Q9NY43 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BARHL2Q9NY43 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
BARHL2Q9NY43 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BARHL2Q9NY43 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BARHL2Q9NY43 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BARHL2Q9NY43 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
BARHL2Q9NY43 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BARHL2Q9NY43 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BARHL2Q9NY43 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BARHL2Q9NY43 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BARHL2Q9NY43 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
BARHL2Q9NY43 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BARHL2Q9NY43 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BARHL2Q9NY43 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BARHL2Q9NY43 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BARHL2Q9NY43 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BARHL2Q9NY43 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
BARHL2Q9NY43 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
BARHL2Q9NY43 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BARHL2Q9NY43 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BARHL2Q9NY43 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BARHL2Q9NY43 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BARHL2Q9NY43 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BARHL2Q9NY43 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BARHL2Q9NY43 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BARHL2Q9NY43 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BARHL2Q9NY43 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BARHL2Q9NY43 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BARHL2Q9NY43 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BARHL2Q9NY43 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BARHL2Q9NY43 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BARHL2Q9NY43 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BARHL2Q9NY43 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BARHL2Q9NY43 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BARHL2Q9NY43 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BARHL2Q9NY43 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BARHL2Q9NY43 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BARHL2Q9NY43 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BARHL2Q9NY43 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BARHL2Q9NY43 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BARHL2Q9NY43 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BARHL2Q9NY43 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BARHL2Q9NY43 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BARHL2Q9NY43 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BARHL2Q9NY43 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BARHL2Q9NY43 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BARHL2Q9NY43 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BARHL2Q9NY43 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms