Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXZ2

DDX43, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX43Q9NXZ2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX43Q9NXZ2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX43Q9NXZ2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX43Q9NXZ2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX43Q9NXZ2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX43Q9NXZ2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX43Q9NXZ2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX43Q9NXZ2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX43Q9NXZ2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX43Q9NXZ2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX43Q9NXZ2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX43Q9NXZ2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX43Q9NXZ2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX43Q9NXZ2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX43Q9NXZ2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX43Q9NXZ2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX43Q9NXZ2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX43Q9NXZ2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX43Q9NXZ2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX43Q9NXZ2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX43Q9NXZ2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX43Q9NXZ2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX43Q9NXZ2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX43Q9NXZ2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX43Q9NXZ2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX43Q9NXZ2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX43Q9NXZ2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX43Q9NXZ2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX43Q9NXZ2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX43Q9NXZ2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX43Q9NXZ2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX43Q9NXZ2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX43Q9NXZ2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX43Q9NXZ2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX43Q9NXZ2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX43Q9NXZ2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX43Q9NXZ2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX43Q9NXZ2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX43Q9NXZ2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX43Q9NXZ2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX43Q9NXZ2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX43Q9NXZ2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX43Q9NXZ2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms