Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IFT57Q9NWB7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IFT57Q9NWB7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IFT57Q9NWB7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IFT57Q9NWB7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IFT57Q9NWB7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IFT57Q9NWB7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IFT57Q9NWB7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IFT57Q9NWB7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IFT57Q9NWB7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFT57Q9NWB7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFT57Q9NWB7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFT57Q9NWB7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFT57Q9NWB7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFT57Q9NWB7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFT57Q9NWB7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFT57Q9NWB7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IFT57Q9NWB7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IFT57Q9NWB7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IFT57Q9NWB7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IFT57Q9NWB7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IFT57Q9NWB7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IFT57Q9NWB7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
IFT57Q9NWB7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IFT57Q9NWB7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IFT57Q9NWB7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IFT57Q9NWB7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IFT57Q9NWB7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IFT57Q9NWB7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IFT57Q9NWB7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IFT57Q9NWB7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IFT57Q9NWB7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
IFT57Q9NWB7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IFT57Q9NWB7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IFT57Q9NWB7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IFT57Q9NWB7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IFT57Q9NWB7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
IFT57Q9NWB7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IFT57Q9NWB7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
IFT57Q9NWB7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
IFT57Q9NWB7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IFT57Q9NWB7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IFT57Q9NWB7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IFT57Q9NWB7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IFT57Q9NWB7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
IFT57Q9NWB7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFT57Q9NWB7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFT57Q9NWB7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFT57Q9NWB7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFT57Q9NWB7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFT57Q9NWB7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFT57Q9NWB7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFT57Q9NWB7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFT57Q9NWB7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
IFT57Q9NWB7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFT57Q9NWB7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFT57Q9NWB7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFT57Q9NWB7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFT57Q9NWB7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFT57Q9NWB7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
IFT57Q9NWB7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IFT57Q9NWB7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IFT57Q9NWB7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
IFT57Q9NWB7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IFT57Q9NWB7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IFT57Q9NWB7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IFT57Q9NWB7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IFT57Q9NWB7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IFT57Q9NWB7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
IFT57Q9NWB7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFT57Q9NWB7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFT57Q9NWB7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFT57Q9NWB7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
IFT57Q9NWB7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IFT57Q9NWB7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IFT57Q9NWB7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IFT57Q9NWB7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IFT57Q9NWB7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IFT57Q9NWB7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IFT57Q9NWB7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IFT57Q9NWB7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IFT57Q9NWB7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IFT57Q9NWB7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IFT57Q9NWB7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IFT57Q9NWB7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IFT57Q9NWB7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IFT57Q9NWB7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IFT57Q9NWB7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IFT57Q9NWB7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IFT57Q9NWB7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IFT57Q9NWB7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IFT57Q9NWB7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IFT57Q9NWB7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IFT57Q9NWB7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IFT57Q9NWB7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IFT57Q9NWB7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IFT57Q9NWB7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFT57Q9NWB7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
IFT57Q9NWB7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFT57Q9NWB7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms