Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO28Q9NVF7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO28Q9NVF7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO28Q9NVF7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO28Q9NVF7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO28Q9NVF7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO28Q9NVF7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO28Q9NVF7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO28Q9NVF7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO28Q9NVF7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO28Q9NVF7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO28Q9NVF7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO28Q9NVF7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO28Q9NVF7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO28Q9NVF7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO28Q9NVF7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO28Q9NVF7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO28Q9NVF7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO28Q9NVF7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO28Q9NVF7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO28Q9NVF7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO28Q9NVF7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO28Q9NVF7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO28Q9NVF7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO28Q9NVF7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO28Q9NVF7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO28Q9NVF7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO28Q9NVF7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO28Q9NVF7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO28Q9NVF7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO28Q9NVF7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO28Q9NVF7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO28Q9NVF7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO28Q9NVF7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO28Q9NVF7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO28Q9NVF7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO28Q9NVF7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO28Q9NVF7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO28Q9NVF7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO28Q9NVF7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO28Q9NVF7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO28Q9NVF7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO28Q9NVF7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO28Q9NVF7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO28Q9NVF7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO28Q9NVF7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO28Q9NVF7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO28Q9NVF7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO28Q9NVF7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO28Q9NVF7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO28Q9NVF7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO28Q9NVF7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO28Q9NVF7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO28Q9NVF7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO28Q9NVF7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO28Q9NVF7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO28Q9NVF7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO28Q9NVF7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO28Q9NVF7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXO28Q9NVF7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXO28Q9NVF7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXO28Q9NVF7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXO28Q9NVF7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXO28Q9NVF7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXO28Q9NVF7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXO28Q9NVF7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXO28Q9NVF7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO28Q9NVF7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO28Q9NVF7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO28Q9NVF7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO28Q9NVF7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO28Q9NVF7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO28Q9NVF7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO28Q9NVF7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO28Q9NVF7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO28Q9NVF7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO28Q9NVF7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO28Q9NVF7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO28Q9NVF7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO28Q9NVF7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO28Q9NVF7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO28Q9NVF7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO28Q9NVF7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO28Q9NVF7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO28Q9NVF7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO28Q9NVF7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FBXO28Q9NVF7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FBXO28Q9NVF7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FBXO28Q9NVF7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FBXO28Q9NVF7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FBXO28Q9NVF7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FBXO28Q9NVF7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FBXO28Q9NVF7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FBXO28Q9NVF7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FBXO28Q9NVF7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FBXO28Q9NVF7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms