Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV12

TMEM140, Transmembrane protein 140, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM140Q9NV12 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms