Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
EMILIN3Q9NT22 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
EMILIN3Q9NT22 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EMILIN3Q9NT22 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EMILIN3Q9NT22 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EMILIN3Q9NT22 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EMILIN3Q9NT22 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EMILIN3Q9NT22 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EMILIN3Q9NT22 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EMILIN3Q9NT22 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
EMILIN3Q9NT22 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EMILIN3Q9NT22 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EMILIN3Q9NT22 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EMILIN3Q9NT22 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EMILIN3Q9NT22 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EMILIN3Q9NT22 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EMILIN3Q9NT22 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EMILIN3Q9NT22 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EMILIN3Q9NT22 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
EMILIN3Q9NT22 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
EMILIN3Q9NT22 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EMILIN3Q9NT22 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EMILIN3Q9NT22 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EMILIN3Q9NT22 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EMILIN3Q9NT22 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EMILIN3Q9NT22 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EMILIN3Q9NT22 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EMILIN3Q9NT22 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EMILIN3Q9NT22 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EMILIN3Q9NT22 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EMILIN3Q9NT22 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EMILIN3Q9NT22 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EMILIN3Q9NT22 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EMILIN3Q9NT22 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EMILIN3Q9NT22 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EMILIN3Q9NT22 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EMILIN3Q9NT22 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EMILIN3Q9NT22 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EMILIN3Q9NT22 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EMILIN3Q9NT22 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EMILIN3Q9NT22 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EMILIN3Q9NT22 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EMILIN3Q9NT22 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
EMILIN3Q9NT22 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EMILIN3Q9NT22 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EMILIN3Q9NT22 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EMILIN3Q9NT22 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EMILIN3Q9NT22 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EMILIN3Q9NT22 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EMILIN3Q9NT22 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EMILIN3Q9NT22 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EMILIN3Q9NT22 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EMILIN3Q9NT22 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
EMILIN3Q9NT22 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EMILIN3Q9NT22 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EMILIN3Q9NT22 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EMILIN3Q9NT22 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EMILIN3Q9NT22 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EMILIN3Q9NT22 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EMILIN3Q9NT22 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EMILIN3Q9NT22 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
EMILIN3Q9NT22 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EMILIN3Q9NT22 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EMILIN3Q9NT22 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EMILIN3Q9NT22 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EMILIN3Q9NT22 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EMILIN3Q9NT22 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
EMILIN3Q9NT22 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
EMILIN3Q9NT22 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EMILIN3Q9NT22 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EMILIN3Q9NT22 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EMILIN3Q9NT22 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EMILIN3Q9NT22 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EMILIN3Q9NT22 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EMILIN3Q9NT22 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EMILIN3Q9NT22 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EMILIN3Q9NT22 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EMILIN3Q9NT22 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EMILIN3Q9NT22 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
EMILIN3Q9NT22 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EMILIN3Q9NT22 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EMILIN3Q9NT22 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EMILIN3Q9NT22 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EMILIN3Q9NT22 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EMILIN3Q9NT22 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EMILIN3Q9NT22 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EMILIN3Q9NT22 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EMILIN3Q9NT22 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EMILIN3Q9NT22 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EMILIN3Q9NT22 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EMILIN3Q9NT22 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
EMILIN3Q9NT22 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EMILIN3Q9NT22 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EMILIN3Q9NT22 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EMILIN3Q9NT22 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EMILIN3Q9NT22 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EMILIN3Q9NT22 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EMILIN3Q9NT22 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EMILIN3Q9NT22 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EMILIN3Q9NT22 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms