Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
RRP7BPQ9NSQ0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
RRP7BPQ9NSQ0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
RRP7BPQ9NSQ0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
RRP7BPQ9NSQ0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
RRP7BPQ9NSQ0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
RRP7BPQ9NSQ0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
RRP7BPQ9NSQ0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
RRP7BPQ9NSQ0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
RRP7BPQ9NSQ0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
RRP7BPQ9NSQ0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
RRP7BPQ9NSQ0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
RRP7BPQ9NSQ0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
RRP7BPQ9NSQ0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
RRP7BPQ9NSQ0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
RRP7BPQ9NSQ0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
RRP7BPQ9NSQ0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
RRP7BPQ9NSQ0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
RRP7BPQ9NSQ0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
RRP7BPQ9NSQ0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
RRP7BPQ9NSQ0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
RRP7BPQ9NSQ0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC32.9■■■□□ 2.86
RRP7BPQ9NSQ0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
RRP7BPQ9NSQ0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC32.9■■■□□ 2.86
RRP7BPQ9NSQ0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
RRP7BPQ9NSQ0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
RRP7BPQ9NSQ0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
RRP7BPQ9NSQ0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
RRP7BPQ9NSQ0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
RRP7BPQ9NSQ0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
RRP7BPQ9NSQ0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
RRP7BPQ9NSQ0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
RRP7BPQ9NSQ0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
RRP7BPQ9NSQ0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
RRP7BPQ9NSQ0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
RRP7BPQ9NSQ0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
RRP7BPQ9NSQ0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
RRP7BPQ9NSQ0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
RRP7BPQ9NSQ0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
RRP7BPQ9NSQ0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
RRP7BPQ9NSQ0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
RRP7BPQ9NSQ0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
RRP7BPQ9NSQ0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
RRP7BPQ9NSQ0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
RRP7BPQ9NSQ0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
RRP7BPQ9NSQ0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
RRP7BPQ9NSQ0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
RRP7BPQ9NSQ0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
RRP7BPQ9NSQ0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
RRP7BPQ9NSQ0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
RRP7BPQ9NSQ0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
RRP7BPQ9NSQ0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
RRP7BPQ9NSQ0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
RRP7BPQ9NSQ0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
RRP7BPQ9NSQ0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
RRP7BPQ9NSQ0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
RRP7BPQ9NSQ0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
RRP7BPQ9NSQ0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
RRP7BPQ9NSQ0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
RRP7BPQ9NSQ0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
RRP7BPQ9NSQ0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
RRP7BPQ9NSQ0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
RRP7BPQ9NSQ0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
RRP7BPQ9NSQ0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
RRP7BPQ9NSQ0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
RRP7BPQ9NSQ0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
RRP7BPQ9NSQ0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
RRP7BPQ9NSQ0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
RRP7BPQ9NSQ0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
RRP7BPQ9NSQ0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
RRP7BPQ9NSQ0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC32.84■■■□□ 2.85
RRP7BPQ9NSQ0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
RRP7BPQ9NSQ0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
RRP7BPQ9NSQ0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
RRP7BPQ9NSQ0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
RRP7BPQ9NSQ0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
RRP7BPQ9NSQ0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
RRP7BPQ9NSQ0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
RRP7BPQ9NSQ0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
RRP7BPQ9NSQ0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
RRP7BPQ9NSQ0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
RRP7BPQ9NSQ0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
RRP7BPQ9NSQ0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
RRP7BPQ9NSQ0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.85
RRP7BPQ9NSQ0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
RRP7BPQ9NSQ0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
RRP7BPQ9NSQ0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
RRP7BPQ9NSQ0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
RRP7BPQ9NSQ0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
RRP7BPQ9NSQ0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
RRP7BPQ9NSQ0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
RRP7BPQ9NSQ0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
RRP7BPQ9NSQ0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
RRP7BPQ9NSQ0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
RRP7BPQ9NSQ0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
RRP7BPQ9NSQ0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
RRP7BPQ9NSQ0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
RRP7BPQ9NSQ0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms