Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOMER3Q9NSC5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOMER3Q9NSC5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOMER3Q9NSC5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOMER3Q9NSC5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOMER3Q9NSC5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOMER3Q9NSC5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOMER3Q9NSC5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOMER3Q9NSC5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOMER3Q9NSC5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOMER3Q9NSC5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOMER3Q9NSC5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOMER3Q9NSC5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOMER3Q9NSC5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOMER3Q9NSC5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOMER3Q9NSC5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOMER3Q9NSC5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOMER3Q9NSC5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HOMER3Q9NSC5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOMER3Q9NSC5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOMER3Q9NSC5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOMER3Q9NSC5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOMER3Q9NSC5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOMER3Q9NSC5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOMER3Q9NSC5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOMER3Q9NSC5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOMER3Q9NSC5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HOMER3Q9NSC5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOMER3Q9NSC5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOMER3Q9NSC5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOMER3Q9NSC5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOMER3Q9NSC5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOMER3Q9NSC5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOMER3Q9NSC5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HOMER3Q9NSC5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOMER3Q9NSC5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOMER3Q9NSC5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOMER3Q9NSC5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOMER3Q9NSC5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOMER3Q9NSC5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOMER3Q9NSC5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOMER3Q9NSC5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOMER3Q9NSC5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOMER3Q9NSC5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOMER3Q9NSC5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOMER3Q9NSC5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOMER3Q9NSC5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOMER3Q9NSC5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOMER3Q9NSC5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOMER3Q9NSC5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOMER3Q9NSC5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOMER3Q9NSC5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOMER3Q9NSC5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms