Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX4

PHPT1, 14 kDa phosphohistidine phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHPT1Q9NRX4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms