Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG4

PCDH12, Protocadherin-12, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH12Q9NPG4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms