Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPE2

NGRN, Neugrin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGRNQ9NPE2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NGRNQ9NPE2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NGRNQ9NPE2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NGRNQ9NPE2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NGRNQ9NPE2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NGRNQ9NPE2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NGRNQ9NPE2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NGRNQ9NPE2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NGRNQ9NPE2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NGRNQ9NPE2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NGRNQ9NPE2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NGRNQ9NPE2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NGRNQ9NPE2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NGRNQ9NPE2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NGRNQ9NPE2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NGRNQ9NPE2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NGRNQ9NPE2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NGRNQ9NPE2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NGRNQ9NPE2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NGRNQ9NPE2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NGRNQ9NPE2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NGRNQ9NPE2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NGRNQ9NPE2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NGRNQ9NPE2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NGRNQ9NPE2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NGRNQ9NPE2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NGRNQ9NPE2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NGRNQ9NPE2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NGRNQ9NPE2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NGRNQ9NPE2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NGRNQ9NPE2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NGRNQ9NPE2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NGRNQ9NPE2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NGRNQ9NPE2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NGRNQ9NPE2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NGRNQ9NPE2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NGRNQ9NPE2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NGRNQ9NPE2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NGRNQ9NPE2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NGRNQ9NPE2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NGRNQ9NPE2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NGRNQ9NPE2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NGRNQ9NPE2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NGRNQ9NPE2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NGRNQ9NPE2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NGRNQ9NPE2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NGRNQ9NPE2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NGRNQ9NPE2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NGRNQ9NPE2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NGRNQ9NPE2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NGRNQ9NPE2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NGRNQ9NPE2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NGRNQ9NPE2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NGRNQ9NPE2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NGRNQ9NPE2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NGRNQ9NPE2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NGRNQ9NPE2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NGRNQ9NPE2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NGRNQ9NPE2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NGRNQ9NPE2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NGRNQ9NPE2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NGRNQ9NPE2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NGRNQ9NPE2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NGRNQ9NPE2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NGRNQ9NPE2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NGRNQ9NPE2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NGRNQ9NPE2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NGRNQ9NPE2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NGRNQ9NPE2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NGRNQ9NPE2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NGRNQ9NPE2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NGRNQ9NPE2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NGRNQ9NPE2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NGRNQ9NPE2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NGRNQ9NPE2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NGRNQ9NPE2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NGRNQ9NPE2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NGRNQ9NPE2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NGRNQ9NPE2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NGRNQ9NPE2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NGRNQ9NPE2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NGRNQ9NPE2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NGRNQ9NPE2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NGRNQ9NPE2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NGRNQ9NPE2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NGRNQ9NPE2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NGRNQ9NPE2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NGRNQ9NPE2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NGRNQ9NPE2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NGRNQ9NPE2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NGRNQ9NPE2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NGRNQ9NPE2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NGRNQ9NPE2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NGRNQ9NPE2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NGRNQ9NPE2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NGRNQ9NPE2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NGRNQ9NPE2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NGRNQ9NPE2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NGRNQ9NPE2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NGRNQ9NPE2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms