Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
A4GALTQ9NPC4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
A4GALTQ9NPC4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
A4GALTQ9NPC4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
A4GALTQ9NPC4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
A4GALTQ9NPC4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
A4GALTQ9NPC4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
A4GALTQ9NPC4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
A4GALTQ9NPC4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
A4GALTQ9NPC4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
A4GALTQ9NPC4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
A4GALTQ9NPC4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
A4GALTQ9NPC4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
A4GALTQ9NPC4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
A4GALTQ9NPC4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
A4GALTQ9NPC4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
A4GALTQ9NPC4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
A4GALTQ9NPC4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
A4GALTQ9NPC4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
A4GALTQ9NPC4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
A4GALTQ9NPC4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
A4GALTQ9NPC4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
A4GALTQ9NPC4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
A4GALTQ9NPC4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
A4GALTQ9NPC4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
A4GALTQ9NPC4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
A4GALTQ9NPC4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
A4GALTQ9NPC4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
A4GALTQ9NPC4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
A4GALTQ9NPC4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
A4GALTQ9NPC4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
A4GALTQ9NPC4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
A4GALTQ9NPC4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
A4GALTQ9NPC4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
A4GALTQ9NPC4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
A4GALTQ9NPC4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
A4GALTQ9NPC4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
A4GALTQ9NPC4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
A4GALTQ9NPC4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
A4GALTQ9NPC4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
A4GALTQ9NPC4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
A4GALTQ9NPC4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
A4GALTQ9NPC4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
A4GALTQ9NPC4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
A4GALTQ9NPC4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
A4GALTQ9NPC4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
A4GALTQ9NPC4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
A4GALTQ9NPC4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
A4GALTQ9NPC4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
A4GALTQ9NPC4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
A4GALTQ9NPC4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
A4GALTQ9NPC4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
A4GALTQ9NPC4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
A4GALTQ9NPC4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
A4GALTQ9NPC4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
A4GALTQ9NPC4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
A4GALTQ9NPC4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
A4GALTQ9NPC4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
A4GALTQ9NPC4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
A4GALTQ9NPC4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
A4GALTQ9NPC4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms