Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB8

GPCPD1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1Q9NPB8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPCPD1Q9NPB8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPCPD1Q9NPB8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPCPD1Q9NPB8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPCPD1Q9NPB8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPCPD1Q9NPB8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GPCPD1Q9NPB8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPCPD1Q9NPB8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPCPD1Q9NPB8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPCPD1Q9NPB8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPCPD1Q9NPB8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPCPD1Q9NPB8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPCPD1Q9NPB8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPCPD1Q9NPB8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPCPD1Q9NPB8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPCPD1Q9NPB8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPCPD1Q9NPB8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPCPD1Q9NPB8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPCPD1Q9NPB8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GPCPD1Q9NPB8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GPCPD1Q9NPB8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPCPD1Q9NPB8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPCPD1Q9NPB8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPCPD1Q9NPB8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPCPD1Q9NPB8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPCPD1Q9NPB8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPCPD1Q9NPB8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPCPD1Q9NPB8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPCPD1Q9NPB8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GPCPD1Q9NPB8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPCPD1Q9NPB8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GPCPD1Q9NPB8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GPCPD1Q9NPB8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GPCPD1Q9NPB8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPCPD1Q9NPB8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GPCPD1Q9NPB8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GPCPD1Q9NPB8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GPCPD1Q9NPB8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GPCPD1Q9NPB8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GPCPD1Q9NPB8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GPCPD1Q9NPB8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPCPD1Q9NPB8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPCPD1Q9NPB8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPCPD1Q9NPB8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPCPD1Q9NPB8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPCPD1Q9NPB8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPCPD1Q9NPB8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPCPD1Q9NPB8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPCPD1Q9NPB8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPCPD1Q9NPB8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPCPD1Q9NPB8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPCPD1Q9NPB8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms