Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP78

ABCB9, ATP-binding cassette sub-family B member 9, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB9Q9NP78 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ABCB9Q9NP78 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ABCB9Q9NP78 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ABCB9Q9NP78 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ABCB9Q9NP78 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ABCB9Q9NP78 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ABCB9Q9NP78 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ABCB9Q9NP78 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ABCB9Q9NP78 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ABCB9Q9NP78 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ABCB9Q9NP78 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ABCB9Q9NP78 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ABCB9Q9NP78 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ABCB9Q9NP78 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ABCB9Q9NP78 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ABCB9Q9NP78 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ABCB9Q9NP78 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ABCB9Q9NP78 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ABCB9Q9NP78 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ABCB9Q9NP78 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ABCB9Q9NP78 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ABCB9Q9NP78 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ABCB9Q9NP78 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ABCB9Q9NP78 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ABCB9Q9NP78 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ABCB9Q9NP78 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ABCB9Q9NP78 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ABCB9Q9NP78 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ABCB9Q9NP78 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ABCB9Q9NP78 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ABCB9Q9NP78 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ABCB9Q9NP78 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ABCB9Q9NP78 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ABCB9Q9NP78 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ABCB9Q9NP78 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ABCB9Q9NP78 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ABCB9Q9NP78 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ABCB9Q9NP78 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCB9Q9NP78 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCB9Q9NP78 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCB9Q9NP78 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCB9Q9NP78 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCB9Q9NP78 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCB9Q9NP78 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCB9Q9NP78 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCB9Q9NP78 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCB9Q9NP78 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCB9Q9NP78 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCB9Q9NP78 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCB9Q9NP78 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCB9Q9NP78 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCB9Q9NP78 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCB9Q9NP78 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCB9Q9NP78 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ABCB9Q9NP78 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABCB9Q9NP78 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABCB9Q9NP78 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABCB9Q9NP78 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABCB9Q9NP78 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABCB9Q9NP78 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABCB9Q9NP78 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABCB9Q9NP78 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABCB9Q9NP78 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABCB9Q9NP78 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABCB9Q9NP78 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABCB9Q9NP78 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABCB9Q9NP78 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABCB9Q9NP78 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABCB9Q9NP78 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ABCB9Q9NP78 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ABCB9Q9NP78 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCB9Q9NP78 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCB9Q9NP78 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCB9Q9NP78 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCB9Q9NP78 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCB9Q9NP78 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCB9Q9NP78 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCB9Q9NP78 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCB9Q9NP78 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCB9Q9NP78 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCB9Q9NP78 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCB9Q9NP78 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCB9Q9NP78 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCB9Q9NP78 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCB9Q9NP78 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCB9Q9NP78 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCB9Q9NP78 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCB9Q9NP78 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCB9Q9NP78 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCB9Q9NP78 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCB9Q9NP78 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCB9Q9NP78 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCB9Q9NP78 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCB9Q9NP78 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCB9Q9NP78 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCB9Q9NP78 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCB9Q9NP78 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCB9Q9NP78 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCB9Q9NP78 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCB9Q9NP78 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms