Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP08

HMX1, Homeobox protein HMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX1Q9NP08 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMX1Q9NP08 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HMX1Q9NP08 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMX1Q9NP08 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMX1Q9NP08 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMX1Q9NP08 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMX1Q9NP08 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMX1Q9NP08 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMX1Q9NP08 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMX1Q9NP08 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMX1Q9NP08 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMX1Q9NP08 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HMX1Q9NP08 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMX1Q9NP08 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMX1Q9NP08 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMX1Q9NP08 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HMX1Q9NP08 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMX1Q9NP08 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HMX1Q9NP08 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMX1Q9NP08 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMX1Q9NP08 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMX1Q9NP08 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMX1Q9NP08 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMX1Q9NP08 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMX1Q9NP08 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMX1Q9NP08 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMX1Q9NP08 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMX1Q9NP08 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HMX1Q9NP08 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HMX1Q9NP08 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HMX1Q9NP08 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HMX1Q9NP08 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HMX1Q9NP08 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HMX1Q9NP08 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HMX1Q9NP08 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HMX1Q9NP08 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HMX1Q9NP08 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HMX1Q9NP08 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HMX1Q9NP08 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HMX1Q9NP08 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMX1Q9NP08 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMX1Q9NP08 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMX1Q9NP08 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMX1Q9NP08 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMX1Q9NP08 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMX1Q9NP08 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMX1Q9NP08 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMX1Q9NP08 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HMX1Q9NP08 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMX1Q9NP08 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMX1Q9NP08 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HMX1Q9NP08 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMX1Q9NP08 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMX1Q9NP08 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMX1Q9NP08 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HMX1Q9NP08 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMX1Q9NP08 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms