Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS7

XAB2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XAB2Q9HCS7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
XAB2Q9HCS7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms