Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
APOBEC3GQ9HC16 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms