Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B4

SMYD3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3Q9H7B4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMYD3Q9H7B4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SMYD3Q9H7B4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMYD3Q9H7B4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMYD3Q9H7B4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMYD3Q9H7B4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMYD3Q9H7B4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMYD3Q9H7B4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMYD3Q9H7B4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMYD3Q9H7B4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMYD3Q9H7B4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMYD3Q9H7B4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMYD3Q9H7B4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMYD3Q9H7B4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMYD3Q9H7B4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMYD3Q9H7B4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMYD3Q9H7B4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMYD3Q9H7B4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMYD3Q9H7B4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMYD3Q9H7B4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMYD3Q9H7B4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMYD3Q9H7B4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMYD3Q9H7B4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMYD3Q9H7B4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMYD3Q9H7B4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMYD3Q9H7B4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SMYD3Q9H7B4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms