Protein–RNA interactions for Protein: Q9H799

C5orf42, Protein JBTS17, humanhuman

Predictions only

Length 3,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf42Q9H799 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C5orf42Q9H799 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C5orf42Q9H799 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C5orf42Q9H799 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C5orf42Q9H799 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C5orf42Q9H799 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C5orf42Q9H799 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C5orf42Q9H799 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C5orf42Q9H799 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C5orf42Q9H799 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C5orf42Q9H799 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C5orf42Q9H799 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C5orf42Q9H799 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C5orf42Q9H799 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C5orf42Q9H799 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C5orf42Q9H799 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
C5orf42Q9H799 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C5orf42Q9H799 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C5orf42Q9H799 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C5orf42Q9H799 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C5orf42Q9H799 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C5orf42Q9H799 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C5orf42Q9H799 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C5orf42Q9H799 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C5orf42Q9H799 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C5orf42Q9H799 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C5orf42Q9H799 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C5orf42Q9H799 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C5orf42Q9H799 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C5orf42Q9H799 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C5orf42Q9H799 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C5orf42Q9H799 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms