Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4F8

SMOC1, SPARC-related modular calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMOC1Q9H4F8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMOC1Q9H4F8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMOC1Q9H4F8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMOC1Q9H4F8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMOC1Q9H4F8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMOC1Q9H4F8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMOC1Q9H4F8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMOC1Q9H4F8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMOC1Q9H4F8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMOC1Q9H4F8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMOC1Q9H4F8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMOC1Q9H4F8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMOC1Q9H4F8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMOC1Q9H4F8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMOC1Q9H4F8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMOC1Q9H4F8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMOC1Q9H4F8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMOC1Q9H4F8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMOC1Q9H4F8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMOC1Q9H4F8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMOC1Q9H4F8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMOC1Q9H4F8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMOC1Q9H4F8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMOC1Q9H4F8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMOC1Q9H4F8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMOC1Q9H4F8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMOC1Q9H4F8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMOC1Q9H4F8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMOC1Q9H4F8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SMOC1Q9H4F8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMOC1Q9H4F8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMOC1Q9H4F8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMOC1Q9H4F8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMOC1Q9H4F8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMOC1Q9H4F8 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMOC1Q9H4F8 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMOC1Q9H4F8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMOC1Q9H4F8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMOC1Q9H4F8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMOC1Q9H4F8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMOC1Q9H4F8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMOC1Q9H4F8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMOC1Q9H4F8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMOC1Q9H4F8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMOC1Q9H4F8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMOC1Q9H4F8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMOC1Q9H4F8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMOC1Q9H4F8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMOC1Q9H4F8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMOC1Q9H4F8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMOC1Q9H4F8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SMOC1Q9H4F8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMOC1Q9H4F8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMOC1Q9H4F8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SMOC1Q9H4F8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SMOC1Q9H4F8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMOC1Q9H4F8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMOC1Q9H4F8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMOC1Q9H4F8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMOC1Q9H4F8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SMOC1Q9H4F8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMOC1Q9H4F8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMOC1Q9H4F8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMOC1Q9H4F8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMOC1Q9H4F8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMOC1Q9H4F8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMOC1Q9H4F8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SMOC1Q9H4F8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMOC1Q9H4F8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMOC1Q9H4F8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMOC1Q9H4F8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMOC1Q9H4F8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMOC1Q9H4F8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMOC1Q9H4F8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SMOC1Q9H4F8 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMOC1Q9H4F8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMOC1Q9H4F8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMOC1Q9H4F8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMOC1Q9H4F8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMOC1Q9H4F8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMOC1Q9H4F8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMOC1Q9H4F8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMOC1Q9H4F8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SMOC1Q9H4F8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SMOC1Q9H4F8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMOC1Q9H4F8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SMOC1Q9H4F8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMOC1Q9H4F8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMOC1Q9H4F8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMOC1Q9H4F8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMOC1Q9H4F8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMOC1Q9H4F8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMOC1Q9H4F8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMOC1Q9H4F8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SMOC1Q9H4F8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMOC1Q9H4F8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMOC1Q9H4F8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMOC1Q9H4F8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMOC1Q9H4F8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMOC1Q9H4F8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms