Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NXF3Q9H4D5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NXF3Q9H4D5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NXF3Q9H4D5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NXF3Q9H4D5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NXF3Q9H4D5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NXF3Q9H4D5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NXF3Q9H4D5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NXF3Q9H4D5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NXF3Q9H4D5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NXF3Q9H4D5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NXF3Q9H4D5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NXF3Q9H4D5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NXF3Q9H4D5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NXF3Q9H4D5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NXF3Q9H4D5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NXF3Q9H4D5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NXF3Q9H4D5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms