Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLSTN2Q9H4D0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLSTN2Q9H4D0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLSTN2Q9H4D0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLSTN2Q9H4D0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLSTN2Q9H4D0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLSTN2Q9H4D0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLSTN2Q9H4D0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLSTN2Q9H4D0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLSTN2Q9H4D0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLSTN2Q9H4D0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLSTN2Q9H4D0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLSTN2Q9H4D0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLSTN2Q9H4D0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLSTN2Q9H4D0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLSTN2Q9H4D0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLSTN2Q9H4D0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLSTN2Q9H4D0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CLSTN2Q9H4D0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CLSTN2Q9H4D0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CLSTN2Q9H4D0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLSTN2Q9H4D0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLSTN2Q9H4D0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLSTN2Q9H4D0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLSTN2Q9H4D0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLSTN2Q9H4D0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLSTN2Q9H4D0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLSTN2Q9H4D0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLSTN2Q9H4D0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLSTN2Q9H4D0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLSTN2Q9H4D0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CLSTN2Q9H4D0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLSTN2Q9H4D0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLSTN2Q9H4D0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CLSTN2Q9H4D0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLSTN2Q9H4D0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLSTN2Q9H4D0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLSTN2Q9H4D0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLSTN2Q9H4D0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLSTN2Q9H4D0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CLSTN2Q9H4D0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLSTN2Q9H4D0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLSTN2Q9H4D0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLSTN2Q9H4D0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLSTN2Q9H4D0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLSTN2Q9H4D0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLSTN2Q9H4D0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLSTN2Q9H4D0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLSTN2Q9H4D0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLSTN2Q9H4D0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLSTN2Q9H4D0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLSTN2Q9H4D0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLSTN2Q9H4D0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLSTN2Q9H4D0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLSTN2Q9H4D0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLSTN2Q9H4D0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLSTN2Q9H4D0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLSTN2Q9H4D0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLSTN2Q9H4D0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLSTN2Q9H4D0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLSTN2Q9H4D0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLSTN2Q9H4D0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLSTN2Q9H4D0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLSTN2Q9H4D0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLSTN2Q9H4D0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLSTN2Q9H4D0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLSTN2Q9H4D0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLSTN2Q9H4D0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLSTN2Q9H4D0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSTN2Q9H4D0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSTN2Q9H4D0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSTN2Q9H4D0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSTN2Q9H4D0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSTN2Q9H4D0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSTN2Q9H4D0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSTN2Q9H4D0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSTN2Q9H4D0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLSTN2Q9H4D0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLSTN2Q9H4D0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLSTN2Q9H4D0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLSTN2Q9H4D0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLSTN2Q9H4D0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLSTN2Q9H4D0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLSTN2Q9H4D0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLSTN2Q9H4D0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLSTN2Q9H4D0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLSTN2Q9H4D0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLSTN2Q9H4D0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSTN2Q9H4D0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSTN2Q9H4D0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSTN2Q9H4D0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSTN2Q9H4D0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSTN2Q9H4D0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSTN2Q9H4D0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSTN2Q9H4D0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSTN2Q9H4D0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSTN2Q9H4D0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSTN2Q9H4D0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSTN2Q9H4D0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSTN2Q9H4D0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms