Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1D9

POLR3F, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3FQ9H1D9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR3FQ9H1D9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR3FQ9H1D9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR3FQ9H1D9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR3FQ9H1D9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR3FQ9H1D9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR3FQ9H1D9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR3FQ9H1D9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR3FQ9H1D9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR3FQ9H1D9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR3FQ9H1D9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR3FQ9H1D9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR3FQ9H1D9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR3FQ9H1D9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR3FQ9H1D9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR3FQ9H1D9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR3FQ9H1D9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR3FQ9H1D9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR3FQ9H1D9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR3FQ9H1D9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR3FQ9H1D9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR3FQ9H1D9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR3FQ9H1D9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR3FQ9H1D9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR3FQ9H1D9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR3FQ9H1D9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR3FQ9H1D9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR3FQ9H1D9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR3FQ9H1D9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR3FQ9H1D9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR3FQ9H1D9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR3FQ9H1D9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR3FQ9H1D9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR3FQ9H1D9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR3FQ9H1D9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR3FQ9H1D9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR3FQ9H1D9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR3FQ9H1D9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR3FQ9H1D9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR3FQ9H1D9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR3FQ9H1D9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR3FQ9H1D9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR3FQ9H1D9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR3FQ9H1D9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR3FQ9H1D9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR3FQ9H1D9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR3FQ9H1D9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR3FQ9H1D9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR3FQ9H1D9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR3FQ9H1D9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR3FQ9H1D9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR3FQ9H1D9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR3FQ9H1D9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR3FQ9H1D9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR3FQ9H1D9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR3FQ9H1D9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR3FQ9H1D9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR3FQ9H1D9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR3FQ9H1D9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR3FQ9H1D9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR3FQ9H1D9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR3FQ9H1D9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR3FQ9H1D9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR3FQ9H1D9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR3FQ9H1D9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR3FQ9H1D9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR3FQ9H1D9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR3FQ9H1D9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR3FQ9H1D9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR3FQ9H1D9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR3FQ9H1D9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR3FQ9H1D9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR3FQ9H1D9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR3FQ9H1D9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR3FQ9H1D9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR3FQ9H1D9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR3FQ9H1D9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR3FQ9H1D9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR3FQ9H1D9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR3FQ9H1D9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR3FQ9H1D9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR3FQ9H1D9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR3FQ9H1D9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR3FQ9H1D9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR3FQ9H1D9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR3FQ9H1D9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR3FQ9H1D9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR3FQ9H1D9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR3FQ9H1D9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR3FQ9H1D9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR3FQ9H1D9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR3FQ9H1D9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR3FQ9H1D9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR3FQ9H1D9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR3FQ9H1D9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR3FQ9H1D9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR3FQ9H1D9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR3FQ9H1D9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR3FQ9H1D9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR3FQ9H1D9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 456.1 ms