Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K1

SLC39A8, Zinc transporter ZIP8, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A8Q9C0K1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms