Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B2

CFAP74, Cilia- and flagella-associated protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP74Q9C0B2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CFAP74Q9C0B2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CFAP74Q9C0B2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CFAP74Q9C0B2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CFAP74Q9C0B2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
CFAP74Q9C0B2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CFAP74Q9C0B2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CFAP74Q9C0B2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CFAP74Q9C0B2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CFAP74Q9C0B2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
CFAP74Q9C0B2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CFAP74Q9C0B2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CFAP74Q9C0B2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CFAP74Q9C0B2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CFAP74Q9C0B2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CFAP74Q9C0B2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CFAP74Q9C0B2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CFAP74Q9C0B2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CFAP74Q9C0B2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CFAP74Q9C0B2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CFAP74Q9C0B2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CFAP74Q9C0B2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CFAP74Q9C0B2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CFAP74Q9C0B2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CFAP74Q9C0B2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CFAP74Q9C0B2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CFAP74Q9C0B2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
CFAP74Q9C0B2 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
CFAP74Q9C0B2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
CFAP74Q9C0B2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CFAP74Q9C0B2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
CFAP74Q9C0B2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CFAP74Q9C0B2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CFAP74Q9C0B2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CFAP74Q9C0B2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CFAP74Q9C0B2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CFAP74Q9C0B2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CFAP74Q9C0B2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CFAP74Q9C0B2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CFAP74Q9C0B2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CFAP74Q9C0B2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CFAP74Q9C0B2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CFAP74Q9C0B2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CFAP74Q9C0B2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CFAP74Q9C0B2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CFAP74Q9C0B2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
CFAP74Q9C0B2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CFAP74Q9C0B2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CFAP74Q9C0B2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CFAP74Q9C0B2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CFAP74Q9C0B2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
CFAP74Q9C0B2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CFAP74Q9C0B2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CFAP74Q9C0B2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CFAP74Q9C0B2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CFAP74Q9C0B2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CFAP74Q9C0B2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CFAP74Q9C0B2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CFAP74Q9C0B2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CFAP74Q9C0B2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CFAP74Q9C0B2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CFAP74Q9C0B2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CFAP74Q9C0B2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CFAP74Q9C0B2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
CFAP74Q9C0B2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CFAP74Q9C0B2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
CFAP74Q9C0B2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
CFAP74Q9C0B2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CFAP74Q9C0B2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CFAP74Q9C0B2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CFAP74Q9C0B2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CFAP74Q9C0B2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
CFAP74Q9C0B2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CFAP74Q9C0B2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CFAP74Q9C0B2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
CFAP74Q9C0B2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CFAP74Q9C0B2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CFAP74Q9C0B2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CFAP74Q9C0B2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CFAP74Q9C0B2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CFAP74Q9C0B2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CFAP74Q9C0B2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CFAP74Q9C0B2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CFAP74Q9C0B2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CFAP74Q9C0B2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
CFAP74Q9C0B2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CFAP74Q9C0B2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
CFAP74Q9C0B2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CFAP74Q9C0B2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CFAP74Q9C0B2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CFAP74Q9C0B2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CFAP74Q9C0B2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CFAP74Q9C0B2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CFAP74Q9C0B2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
CFAP74Q9C0B2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CFAP74Q9C0B2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CFAP74Q9C0B2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CFAP74Q9C0B2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CFAP74Q9C0B2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CFAP74Q9C0B2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms