Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT23Q9C075 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT23Q9C075 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT23Q9C075 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT23Q9C075 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT23Q9C075 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT23Q9C075 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT23Q9C075 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT23Q9C075 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT23Q9C075 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT23Q9C075 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT23Q9C075 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT23Q9C075 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT23Q9C075 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT23Q9C075 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT23Q9C075 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT23Q9C075 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT23Q9C075 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT23Q9C075 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT23Q9C075 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT23Q9C075 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT23Q9C075 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT23Q9C075 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT23Q9C075 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT23Q9C075 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT23Q9C075 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT23Q9C075 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT23Q9C075 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT23Q9C075 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT23Q9C075 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT23Q9C075 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT23Q9C075 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT23Q9C075 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT23Q9C075 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT23Q9C075 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT23Q9C075 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT23Q9C075 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT23Q9C075 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT23Q9C075 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT23Q9C075 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT23Q9C075 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT23Q9C075 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT23Q9C075 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT23Q9C075 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT23Q9C075 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT23Q9C075 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT23Q9C075 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT23Q9C075 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT23Q9C075 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT23Q9C075 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT23Q9C075 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT23Q9C075 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT23Q9C075 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KRT23Q9C075 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
KRT23Q9C075 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms