Protein–RNA interactions for Protein: Q9C026

TRIM9, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM9, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM9Q9C026 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM9Q9C026 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM9Q9C026 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms