Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms