Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZS1

FOXP3, Forkhead box protein P3, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP3Q9BZS1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms