Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY43

CHMP4A, Charged multivesicular body protein 4a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4AQ9BY43 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHMP4AQ9BY43 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHMP4AQ9BY43 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CHMP4AQ9BY43 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHMP4AQ9BY43 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CHMP4AQ9BY43 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHMP4AQ9BY43 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHMP4AQ9BY43 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHMP4AQ9BY43 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHMP4AQ9BY43 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHMP4AQ9BY43 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHMP4AQ9BY43 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHMP4AQ9BY43 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHMP4AQ9BY43 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHMP4AQ9BY43 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHMP4AQ9BY43 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHMP4AQ9BY43 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHMP4AQ9BY43 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHMP4AQ9BY43 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHMP4AQ9BY43 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHMP4AQ9BY43 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHMP4AQ9BY43 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHMP4AQ9BY43 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CHMP4AQ9BY43 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHMP4AQ9BY43 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHMP4AQ9BY43 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHMP4AQ9BY43 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHMP4AQ9BY43 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHMP4AQ9BY43 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHMP4AQ9BY43 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHMP4AQ9BY43 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHMP4AQ9BY43 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHMP4AQ9BY43 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHMP4AQ9BY43 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHMP4AQ9BY43 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHMP4AQ9BY43 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHMP4AQ9BY43 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHMP4AQ9BY43 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHMP4AQ9BY43 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHMP4AQ9BY43 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHMP4AQ9BY43 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMP4AQ9BY43 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMP4AQ9BY43 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMP4AQ9BY43 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMP4AQ9BY43 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMP4AQ9BY43 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMP4AQ9BY43 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMP4AQ9BY43 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMP4AQ9BY43 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMP4AQ9BY43 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMP4AQ9BY43 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMP4AQ9BY43 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMP4AQ9BY43 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMP4AQ9BY43 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMP4AQ9BY43 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMP4AQ9BY43 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMP4AQ9BY43 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHMP4AQ9BY43 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHMP4AQ9BY43 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHMP4AQ9BY43 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHMP4AQ9BY43 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHMP4AQ9BY43 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHMP4AQ9BY43 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHMP4AQ9BY43 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHMP4AQ9BY43 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHMP4AQ9BY43 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHMP4AQ9BY43 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHMP4AQ9BY43 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHMP4AQ9BY43 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHMP4AQ9BY43 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHMP4AQ9BY43 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CHMP4AQ9BY43 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHMP4AQ9BY43 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHMP4AQ9BY43 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CHMP4AQ9BY43 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMP4AQ9BY43 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMP4AQ9BY43 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMP4AQ9BY43 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMP4AQ9BY43 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMP4AQ9BY43 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMP4AQ9BY43 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMP4AQ9BY43 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMP4AQ9BY43 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMP4AQ9BY43 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMP4AQ9BY43 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMP4AQ9BY43 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMP4AQ9BY43 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMP4AQ9BY43 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMP4AQ9BY43 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMP4AQ9BY43 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHMP4AQ9BY43 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHMP4AQ9BY43 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHMP4AQ9BY43 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHMP4AQ9BY43 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHMP4AQ9BY43 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHMP4AQ9BY43 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CHMP4AQ9BY43 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHMP4AQ9BY43 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHMP4AQ9BY43 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHMP4AQ9BY43 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms